CĐCS trường MN Bảo Ninh có 48 đoàn viên, lao động đều là nữ. Việc làm của đoàn viên, người lao động được bố trí theo định mức quy định của ngành và phù hợp với chuyên môn đào tạo. Vào đầu các năm học, công đoàn phối hợp với chuyên môn phát động các phong trào thi đua “dạy tốt, học tốt”; “Giỏi việc trường đảm việc nhà”; “Xây dựng trường học thân thiện học sinh tích cực”; “Xây dựng nếp sống văn minh đô thị trong nhà trường”... Công đoàn nhà trường cũng tạo mọi điều kiện cho đoàn viên tham gia học tập nâng cao trình độ lý luận chính trị, chuyên môn, nghiệp vụ; chăm lo đời sống, bảo vệ các quyền, lợi ích hợp pháp, chính đáng của người lao động. Từ năm 2012 đến nay, CĐCS trường MN Bảo Ninh liên tục được công đoàn các cấp khen thưởng, riêng năm học 2016-2017 được Liên đoàn lao động tỉnh tặng cờ thi đua xuất sắc.